Zotero是一款完全免费、开源的文献管理工具，覆盖从文献查找、分类整理、精读笔记，到论文引用、参考文献导出的全流程。没有付费门槛，功能还很强大，值得每个科研人花点时间熟悉它。

第一步：基础安装与必备组件

用好Zotero，首先得把“三件套”装齐：

Zotero桌面客户端：去官网下载，Windows和Mac都能用。

Zotero Connector浏览器插件：这是核心利器！装在Chrome、Edge或Firefox上，后面去PubMed、知网、Web of Science看到文献，点一下插件图标就能一键抓取。安装路径：Zotero顶部菜单「工具→安装浏览器连接器」。

Word/WPS插件：客户端自带，装好以后Word里会出现Zotero选项卡，写论文插入引文就靠它。

另外，去官网注册一个免费账号，在客户端的「编辑→首选项→同步」里登录，这样电脑、手机上的文献和笔记就能云端同步，多设备随时查阅。

第二步：批量抓取/导入文献

方式1：浏览器一键抓取（最常用）

打开PubMed、知网或万方，检索关键词。点浏览器右上角的Z图标：

看单篇文献：直接保存题录，还会自动下载PDF（如果能获取到）。

看检索结果页：图标会变成文件夹样式，可以勾选多篇文献批量导入。

方式2：DOI/PMID快速导入

点击Zotero顶部的“魔法棒”图标，输入文献的DOI或PMID号，一秒就能自动补全全部期刊、作者、摘要等信息，特别高效。

3：批量导入检索结果

从Web of Science、知网等数据库导出RIS格式文件，然后在Zotero里选择「文件→导入」，一次性可以收纳上百篇文献。

中文文献适配插件（强烈推荐）

处理中文文献时，强烈推荐安装Jasminum（茉莉花） 插件。它能解决知网CAJ抓取不全、作者名字乱码等问题，还能自动下载中文PDF、规范题录信息，省心不少。

第三步：文献分类管理

文献一多，分类管理就特别重要，不然根本找不到。

集合（文件夹）分层：在左侧栏新建集合（可以理解为文件夹），按自己的课题拆分成不同层级。比如一个总课题下，可以按“子课题A”“综述文献”“实验方法”等建立子文件夹。

标签+星级快速筛选：

星级：用1-5星标记文献价值，比如5星给顶刊的核心结论文献，方便优先阅读。

自定义标签：可以给文献打上标签。后期写综述时，输入标签就能一键筛选出全部相关文献，非常高效。

清理重复文献：用「工具→查找重复项」功能，一键合并重复的文献条目，把PDF和笔记统一起来，保持文库整洁。

第四步：PDF精读与科研笔记

原生功能：双击PDF，用内置阅读器就可以高亮、批注、截图、做笔记。所有批注会自动绑定到对应的文献条目上，以后通过关键词检索也能同步搜到批注内容。

进阶插件（医学等方向科研刚需）：

Better Notes / ZotCard：提供结构化笔记模板，可以按照研究设计、样本量、分组方案、关键结果、局限性等模块记录，还能导出为Markdown格式，方便写论文引言和讨论时使用。

PDF Translate / Doc2X：实现英文全文的双语对照翻译，专业术语翻译比较准确，不用来回切换网页查词。

Zotero IF：在文献列表里直接显示期刊影响因子、JCR分区、被引次数，方便快速筛选出高分文献。

第五步：论文写作引用

这是Zotero的核心功能，用好了能节省大量格式调整时间。

在Word/WPS中插入引文：

打开Word，顶部会出现「Zotero」选项卡。

把光标放在正文需要引用的位置，点击 Add/Edit Citation。

在弹出框里搜索作者名或标题，选择对应的文献，系统会自动生成上角标如[1][2]。

最后在文末点击 Add/Edit Bibliography，参考文献列表就一键生成了。

切换引用格式：在「编辑→首选项→引用→获取更多样式」里，可以下载各种期刊和学校的格式要求：

毕业论文：一般用GB/T 7714-2015（国标）。

SCI期刊：可以下载AMA、APA、NLM等医学或各学科常用格式。
最方便的是，所有格式可以全局一键切换，全文引文和参考文献列表会自动刷新，不用手动去改标点和作者顺序。

两种输出方案：

写论文正文：用Word的动态引用功能，增删文献后序号会自动更新。

发公众号或其他平台：选中文献，右键选择「创建参考文献表」，然后复制纯文本粘贴。这样不会带上冗余的HTML代码，避免文字截断或宽度错乱的问题。

第六步：一个完整的课题流程示例

假设你要做一个关于“TIR与腹腔感染预后”的研究，流程可以是这样的：

在PubMed检索相关关键词，用Connector批量抓取文献入库。

新建集合，按“TIR分组”“RCS分析”“亚组分析”等逻辑建立子文件夹分类。

用5星标记高分队列研究文献，用ZotCard记录每篇的分组方式、HR值、样本量和事件数等关键结果。

写论文方法或结果部分时，在Word里插入引用，统一使用目标格式。

定稿后，复制纯文本格式的参考文献，直接用于投稿或整理到公众号文章里。

七、常见避坑要点

用Zotero时，有几个地方稍加注意，能省去很多麻烦：

复制参考文献：往公众号或其他网页编辑器粘贴时，务必选择「复制到剪贴板纯文本」，避免HTML代码导致格式错乱。

必备插件：处理中文文献，记得装Jasminum；筛选文献，记得装IF插件，能显著提升效率。

保持后台运行：写论文时，Zotero客户端要全程保持打开，否则Word里的引用功能会失效。

同步空间管理：如果免费云空间不够用了，可以清理一些老旧PDF，或者改用本地云盘（如坚果云）来同步附件文件夹。

八、极简工作流总结

检索抓取文献 → 分类打标签 → 精读做笔记 → Word写作时动态插入引文 → 一键生成规范的参考文献列表 → 按需导出（论文或纯文本）。