之前我们分享过如何使用VASP计算Bader电荷，并且如何分析具体的数值。这一期向大家介绍如何在原子结构上直观地看到原子得失电子的情况，使用VMD软件按照Bader电荷对原子进行着色。

操作步骤

以Au吸附O的结构为例，计算Bader电荷。

(1) 计算完成Bader电荷后，运行vaspkit，选择5/508，得到bader.pqr文件；

(2) 将bader.pqr文件直接拖入到VMD软件中，点击Graphics，选择Representation。

在弹出的对话框中，对Draw style进行设置，将着色方式更改为Charge电荷，Drawing Method选择VDW（也可选择CPK）。

再分别对Trajectory和Periodic进行设置。Color Scale Date Range是调节颜色的范围；Periodic是用来扩展晶胞的大小，可以选择不同的方向进行扩胞。

(3) 在Display中，选择Orthographic，以及在Rendermode选择GLSL。

便得到了按照Bader原子电荷来着色的原子结构图。在这个图中，蓝色是带负电，说明原子得到电子；而红色表示带正电，说明原子失去电子。