我们将继续以Ni(111)上SO2的吸附情况为例演示如何使用Materials Studio中Adsorption Locator 模块。

操作步骤

(3) 设置Adsorption Locator 模块计算参数；

首先双击选中我们之前建立好的Ni(111)的结构，然后单击Adsorption Locator模块后的箭头选择Calculation。在弹出的对话框中，Setup选项卡上，设置精度Quality为Fine。从吸附质Adsorbate下拉列表中选择经过Forcite优化后的SO2.xsd文件，将加载数量Loading设置为1。在Energy选项卡下，将力场Forcefield选择为COMPASSIII。

在Location选项卡下，选中Surface region defined by atom set由原子集合定义的表面区域。

接下来定义表面区域。选中表面层的Ni原子，被选中的原子显示为黄色。在Location选项卡中，单击Add按钮，从而将选定的原子包含在吸附计算设置的目标原子集合中。选中Set maximum adsorption distance复选框，设置最大吸附距离为5.0 Å。（如果最大吸附距离设置太短，则无法创建某些吸附构型；如果太长，则不会添加新构型。）

在Properties选项卡下，选中所有属性的复选框。选择Fixed energy window固定能量窗口选项，并输入100 kcal/mol的值，该选项是选择报告哪些构型。在这种情况下，这将返回与最低构型能量相差小于100 kcal/mol的所有吸附构型。在初始计算中，可以使用更宽的能量窗口，因为这样可以确保不会遗漏重要构型。

单击Run，开始计算。

(4) 查看结果；

在计算完成的文件夹内，打开Ni (1 1 1) Fields.xsd。该文件显示了吸附位点的区域，密度越高的点是越可能的吸附位置。在文档中单击鼠标右键，选择Display Style。在Field选项卡下，选择Color by field values按域值显示颜色，和Volume 体显示样式，关闭对话框。绿色区域表示更可能的吸附位置，而红色表示不太可能的吸附位置。

打开表格文件Ni (1 1 1).std。表格文件中包含了最低能量构型的结构和能量。双击表格中Structures下的结构，即可查看最低能量构型。我们再将非表层原子隐藏，可以明显地看到Ni (1 1 1)上以桥位吸附SO2能量最低，这与文献报道一致（Surface science, 2006, 600: 1827-1836）。