在相较传统的SciFinder，除了逆合成功能外，其结构搜索功能或许更受研发人员青睐，通过CAS号、smiles、或者使用画布绘制出自己想要搜索的结构进行搜索，在搜索结果界面可以点击反应查询/获取参考，从而查看相关的合成路线以及对应文献。

这种方式的优势是严谨，反应完全基于对应参考文献或者专利，用户可以通过多文献/专利进行比较选择最为合适的路线，并直接进入原文献/专利查看相关内容。劣势则是较为耗费研发人员的精力与时间，需要在海量文献中对合适的路线进行筛选，尤其是面对复杂结构时，繁琐的路线对用户更是一种考验。同时由于完全基于已发表文献/专利，对于一些结构会存在无法搜索到相关合成路线的情况。

对于ChemAIRS，在通过逆合成搜索功能得到结果后，用户可以基于排序选择出成本最低/难度最低/步数最短的合成路线，在路线详情界面，可以点击对应分子下的“更多”，对分子进行自由操作，例如编辑分子、上/替换保护基等，同时路线也会根据用户的修改进行对应的优化。点击对应反应节点，可以查看该节点相关参考来源以及反应条件，用户也可以基于自身想法对该步反应进行修改，例如添加反应物、插入分子、重新推导等。

如果想对某一反应节点参考进行更换，用户通过“更多条件”即可跳转到对应反应条件搜索界面。该界面左侧上方是相关的条件列表，可以通过选择不同条件展示所匹配的反应路线，下方则是该反应中可能存在的风险项，即反应中的风险官能团或者相关的副反应位点，用户可以点击文字查看对应解释，根据自身想法选择是否兼容。

界面中间则是条件展示，支持用户通过多方面对展示内容进行筛选，包括文献、反应条件、手性、工艺放大等，也可以通过相似度或收率对展示内容进行排序。在展示反应条件、步骤的同时，用户可以点击DOI或链接直接跳转到相关文献/专利进行查看。

界面右侧是该反应的风险反应位点，以及已选择的参考条件，用户可以点击查看具体风险反应。

相比ChemAIRS，SciFinder更注重与文献的联系，结构搜索功能完全基于其数据库收录的文献及专利，研发人员直接按照文献/专利内描述进行复刻；ChemAIRS则是帮助加速探索可能的策略，即使对于没有直接文献/专利的化合物，也可以通过AI技术，根据类似结构模拟出相关建议路线，基于大量数据的建议路线更具有启发性。