16S扩增子测序OTU或ASV丰度表前处理

16S扩增子测序OTU或ASV丰度表前处理
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主讲老师R语言生信数据分析与可视化
更新时间2024-10-10 11:05:58
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课程介绍
讲师介绍

R语言生信数据分析与可视化
985硕士毕业,哔哩哔哩R语言UP主喔偷偷爱上你,突破2500粉丝。
AI课程导读
如果你手里有一张测序公司返回的16S OTU/ASV丰度表,却不知道怎么把它变成能直接用于后续分析的数据,这节课就是为你准备的。课程围绕OTU/ASV丰度表清洗实操展开,从Excel合并分类信息,到R读入导出、剔除叶绿体线粒体、抽平均一化、计算相对丰度、过滤低丰度与低出现频率OTU,再到分类信息回填去重,完整走通从原始表到分析用表的流程。适合微生物组、16S扩增子方向的初学者,以及需要独立处理测序数据的研究生和科研人员。学完后,你能理解每一步过滤和均一化的意义,能根据研究需求选择阈值,并用Excel与R输出干净、规范、带分类信息的OTU丰度表,为后续α/β多样性、物种组成和差异分析打好基础。
AI课程大纲
R语言生信数据分析与可视化
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