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R+Gephi进行微生物OTU水平网络分析

共1节 已有4人学过

主讲老师R语言生信数据分析与可视化

更新时间2025-04-24 20:30:00

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课程介绍

运用R和Gephi进行共现网络分析

讲师介绍

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R语言生信数据分析与可视化

985硕士毕业,哔哩哔哩R语言UP主喔偷偷爱上你,讲授R语言数据分析及可视化,粉丝突破2500,受到同学们好评。

AI课程导读

本课程围绕R语言微生物OTU网络分析与Gephi可视化展开,带你从OTU分布表出发,完成Spearman相关计算、阈值筛选、P值Bonferroni校正,并生成相关性矩阵、边表和节点表;再结合分类注释信息,在Gephi中完成网络导入、布局稳定、按门着色、按度调整节点大小,以及按正负相关设置红绿边,最终导出可发表的网络图。课程强调实操与参数理解,既适合微生物组、生态学和生物信息分析初学者,也适合希望补齐共现网络可视化技能的科研人员。学完后,你将能独立搭建从R分析到Gephi成图的完整流程,理解网络稀疏与数据规模的关系,并具备解读和优化微生物共现网络图的能力。

AI课程大纲

R语言生信数据分析与可视化

985硕士毕业,哔哩哔哩R语言UP主喔偷偷爱上你,讲授R语言数据分析及可视化,粉丝突破2500,受到同学们好评。

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