
R语言实现TCGA数据分析
共23节 已有7人学过
主讲老师粉面菜蛋肠_
更新时间2024-11-14 17:20:00
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粉面菜蛋肠_
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AI课程导读
这是一套面向癌症多组学研究的TCGA实战课程,以R语言为主线,带你从数据库入门一路走到可复现的生存预测模型。课程先介绍TCGA/GDC与Barcode规则,再用TCGAbiolinks完成RNA-Seq、miRNA数据下载和整理;随后系统讲解edgeR、DESeq2、limma差异分析,以及火山图、热图、PCA、韦恩图等结果展示。在临床挖掘部分,你将学习生存数据清洗、单因素与多因素Cox回归、Lasso筛选、列线图、校准曲线、KM曲线、风险评分和时间依赖ROC,并完成模型内部与外部验证。最后通过GO/KEGG富集、GOplot和ggplot2可视化,把基因列表提升到生物学通路层面。适合有基础R语言能力、希望开展肿瘤生物信息学或临床预后研究的医学生、研究生和科研人员。学完后,你能独立搭建从TCGA数据下载、差异分析到预后建模与富集可视化的完整分析流程。
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