课程介绍
本课程介绍了分子动力学基础理论与常见生物体系力场,并在此基础上对常规细胞膜体系(药物分子与细胞膜相互作用、多肽与细胞膜相互通以及膜蛋白体系)的分子动力学模拟进行教学。重点讲解了细胞膜模型构建(CHARMM-GUI)以及药物分子模型构建及优化,分子动力学流程及结果分析,从而使学员能独自使用Gromacs软件进行常规细胞膜体系的分子动力学模拟。此外还介绍了相关文件处理技巧以及后续的可视化视图绘制(VMD和PyMOL)。
讲师介绍
拥有4年gromacs等动力学软件使用经验。主要研究生物大分子在纳米材料表面的吸附,抗肿瘤纳米颗粒和聚合物体系自组装,纳滤膜混合溶液分离和离子过滤等。截至目前,在国内外期刊上发表学术论文多篇,SCI检索3篇,其中第一作者SCI检索论文2篇
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