最全的菌落图教程(特点为:包含spearman相关系数计算加速包,可加速3600倍)

菌落图(network)
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主讲老师R语言
更新时间2025-09-09 18:17:02
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AI课程导读
本课程带你完成从 OTU/ASV 与环境变量相关矩阵,到 OTU 共现网络构建、Gephi 可视化与论文级出图的完整闭环。适合微生物组、生态、测序数据分析初学者,以及希望提升网络分析效率的科研人员。你将学会选择 Pearson/Spearman、计算相关与偏相关、用 R/P 阈值筛选显著关系、生成边表和节点表、设置无向加权网络、识别并修正 P 值校正问题;还能用并行计算把大矩阵相关分析从数小时压缩到数秒,并在 Gephi 与 AI 中完成布局、着色、统计、图例补充和高分辨率导出。学完后,你能独立把原始 OTU 表推进为可解释、可发表的相关网络图,并掌握常见易错点与高效实操流程。
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