本课程围绕单倍型遗传多样性分析展开，从概念、意义到完整实操流程，带你用MEGA11、DnaSP、Arlequin和PopART等常用软件，完成序列比对、碱基组成统计、遗传距离与进化树构建、AMOVA与Fst分化分析、单倍型分布、错配分布、Tajima's D/Fu's Fs中性检验，以及单倍型网络图和ML进化树等核心内容。课程以黄河鲤鱼线粒体COI/Co基因案例贯穿，既讲参数含义和图表解读，也讲文件准备、软件设置、结果整理与论文级制图。适合群体遗传学、分子生态学、水产与动物育种、保护生物学等方向的本科生、研究生和科研人员，尤其适合希望从零掌握单倍型分析全流程的人。学完后，你不仅能理解单倍型多样性、遗传分化与种群历史动态，还能独立完成数据整理、结果判读和图表输出，为论文写作与后续Structure、PCA、Mantel等高级分析打下基础。