
物种组成堆叠柱状冲击图
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主讲老师R语言
更新时间2025-09-24 14:59:13
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AI课程导读
想用 R 快速做出清晰、规范的物种组成冲击图?本课程以“前 10 个门水平 + others、4 组 × 5 重复分组比较”为实战案例,带你完整走通从数据整理到出图的流程。内容包括:输入 OTU/物种丰度表的格式要求,最后一列必须为 group;按分组合并重复样本、计算行和并排序;提取 Top10,将其余归为 others;计算相对丰度/百分比、宽转长并导出占比结果;最后用 R 调整顺序、颜色、柱宽、标签和字体,导出 PDF。课程尤其强调 unidentified、已有 others 等异常类别的归并处理,保证非 others 类别为 10 个。适合微生物组、生态、生信等方向需要绘制物种组成图的初学者和科研人员。学完后,你能理解冲击图的分组比较逻辑,掌握可复用的代码流程,并根据自己的数据修改关键行和图形参数,独立完成发表级物种组成图。
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