想真正做好GEO数据挖掘，关键不是会点鼠标，而是能把公共数据整理成可用于差异分析和后续建模的基因表达矩阵。本课程以GSE64634/GPL570为例，带你理清GSE、GSM、GPL的关系，掌握getGEO下载、表达矩阵与样本信息提取、平台注释、探针到Gene Symbol转换、重复基因按平均/最大/最小合并，以及合并前负值置0等易错细节。课程还比较R包注释与平台文件注释、手动下载与Raw data+RMA标准化流程，帮助你理解GEO2R与精细R分析的区别。适合生信入门者、临床科研人员及需要复现公共数据挖掘的研究者。学完后，你将能独立完成从GEO下载到“行=基因Symbol、列=样本”表达矩阵整理，并输出规范CSV，为后续差异分析、富集分析和论文复现打牢基础。