本课程带你用 R 语言完成 UMAP 降维与分群可视化的完整流程：从数据导入、行名设置，到 umap 与 uwot 两种包的运算、坐标整理，再到 ggplot 分组着色、形状区分、置信椭圆绘制以及 PDF/PNG 保存。课程以 A/B/C 三组各 50 个样本的 OTU 数据为例，既说明 UMAP 与 PCA、t-SNE 的相似用途，也重点比较 umap 包需提取 layout、uwot 包可直接使用坐标等差异，并提醒样本顺序对应、安装失败时如何借助离线包、Rtools 和 R 版本排查。适合需要做微生物组、生信或一般样本分群展示的 R 用户，尤其适合想快速上手降维图并避开常见坑的人。学完后，你能独立完成数据准备、两种 UMAP 实现、结果比较、分组绘图和图片输出，也能根据示例代码复现课程图表。