本课程围绕R语言ComBat批次校正实战展开，以两个基因表达数据集的预处理、合并与校正为主线，带你从零跑通完整分析流程。你将学习如何导入表达矩阵或GEO数据、删除全零基因、判断并统一log转换、取基因交集后合并样本，并正确构造batch、group、type等与列名严格对应的批次与分组信息。课程重点强调“能不合并不校正就尽量不做”，理解ComBat只能校正线性批次误差，不能解决非线性效应，同时掌握校正后负值处理的风险与边界。学完你还能用PCA/t-SNE比较校正前后样本分布，判断批次是否真正混合，并输出可用于后续分析的CSV结果。课程提供基础版与进阶版两种代码方案，适合正在处理GEO数据、多数据集合并、表达谱批次校正的生信初学者和R语言使用者。若你希望少踩坑、建立可复现的ComBat校正流程，这门课将给你一套清晰、可落地的实战方案。