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Starbase的RNA互做数据库

共1节 已有3人学过

主讲老师R语言

更新时间2025-10-28 18:51:05

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AI课程导读

这门课将带你用“RNA 互作数据库 + R 调用 API”,高效完成 RNA-RNA 互作数据的批量下载、合并、清洗与筛选。相比逐个基因手动查询,这套流程能显著提升数据获取效率,并直接产出可用于后续分析的结构化结果。课程会讲解数据库 Quick Search、RNA-to-RNA 数据类型、Ensembl ID、基因 symbol、物种 HG38/MM10 等关键信息,也会拆解 API 链接中的物种、基因类型、基因名等参数,帮你真正理解批量下载逻辑。 适合正在研究 mRNA、lncRNA、RNA 互作机制,或需要批量获取互作数据的研究生、科研人员和生信初学者。只要你有基础 R 操作需求,就能按脚本修改基因列表、物种和筛选条件。 学完后,你能独立完成:准备基因 CSV、运行 R 脚本循环下载、合并 TXT 生成 merge 表、去除 NA、按 protein_coding 或 lncRNA 等类型筛选,并导出“RNA互作.csv”。课程还提醒解压、关闭 R/RStudio、不要随意改列名等实操细节,让你少踩坑,快速把 RNA 互作数据变成可用分析素材。

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