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Gromacs 生物分子模拟课程

共4节 已有112人学过

主讲老师王老师-MD

更新时间2026-08-21 18:22:30

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课程介绍

课程介绍

课时1:回旋半径Rg分析

课时2:回旋半径Rg操作1

课时3:回旋半径Rg操作2

课时4:氢键分析理论

讲师介绍

主要从事生物与医药相关的模拟计算工作,研究方向为药物筛选与研发,载药纳米粒载药与药物释放机制的理论研究。

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王老师-MD

天玑智研.学术共享平台是面向科研工作者、高校、科研院所及研发型企业的专业性社会化平台,为生化环材等领域提供学术交流、专业知识、学术热点以及科研服务。

AI课程导读

本课程聚焦生物分子模拟中的回旋半径Rg分析,带你从概念、公式到GROMACS实操,完整掌握这一衡量蛋白质尺寸与折叠状态的核心指标。你将理解Rg的质量加权定义及其物理意义,学会判断紧密天然态、松散变性态与无序结构;掌握GROMACS计算Rg的关键参数,如输入拓扑、轨迹、起止时间、周期性边界校正和权重模式;并能解读Rg曲线平稳、上升、下降背后的构象变化,结合ΔRg ±0.1 nm判断稳定性,通过轴向分量分析分子各向异性。课程还介绍如何用SAXS/SANS实验数据验证模拟结果,以及偏差超过10%时的处理思路。适合生物物理、计算化学、分子模拟及蛋白质结构研究方向的初学者和进阶学习者。学完后,你将能独立完成Rg计算、结果解读与实验对照,为结构稳定性、折叠机制和构象动力学研究打下扎实基础。

AI课程大纲

天玑智研

王老师-MD

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